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課程名稱 |
生物分子動力學
BIOMOLECULAR KINETICS |
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開課學期 |
97-1 |
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授課對象 |
生命科學院 營養科學組 |
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授課教師 |
楊健志 |
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課號 |
MBC5015 |
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課程識別碼 |
B47 U1230 |
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班次 |
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學分 |
2 |
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全/半年 |
半年 |
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必/選修 |
必修 |
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上課時間 |
星期四1,2(8:10~10:00) |
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上課地點 |
農化二B10 |
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備註 |
與陸駿逸、陳佩燁合開
總人數上限：40人 |
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Ceiba 課程網頁 |
http://ceiba.ntu.edu.tw/971ec |
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課程簡介影片 |
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核心能力關聯 |
核心能力與課程規劃關聯圖 |
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課程大綱
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為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
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課程概述 |
生物分子動力學係銜接生物化學，討論生物分子間交互作用的原理與研究方法。以蛋白質
之結構與功能，它們如何辨認、結合其他生物分子或催化反應進行，可以利用動力
學及光譜學的方法加以研究，未知生理功能之蛋白質可利用酵母菌雙雜交法等分子生物學
操作找出有交互作用的其他蛋白質。這些知識可做為進一步蛋白質設計或試管內演化的基
礎。並延伸討論至 protein-ligand 及細胞內訊息傳導的研究。本課程預計與原研究所之
酵素化學交
替開授。 |
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課程目標 |
1.Structure and Function Relationship of Proteins
2.Basic Enzyme Kinetics andMathematic Aspects
3. Protein Evolution and Protein-protein Interaction
4. Methods and Tools for Measuring Kinetics Parameters
5. Protein-ligand Interaction and Signal Transduction |
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課程要求 |
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預期每週課後學習時數 |
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Office Hours |
每週四 10:10~12:00 |
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指定閱讀 |
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參考書目 |
1.Protein-ligand interactions from molecular recognition to
drug design (2003) edited by H.-J. Bohm and G. Schneider.
Wiley-VCH 3527305211
2. Structural Bioinformatics (Methods of Biochemical
Analysis, V. 44) (2003) Philip E. Bourne, Helge Weissig
Wiley-Liss 0471201995
3. Directed molecular evolution of proteins : or how to
improve enzymes for biocatalysis (2002) Brakmann, Susanne.;
Johnsson, Kai. Wiley-VCH 3527304231
4. Enzymes: A Practical Introduction to Structure,
Mechanism, and Data Analysis (2000) Robert A. Copeland
Wiley-VCH 0471359297
5. Current protocols in protein science Wiley-Interscience
6. Spectroscopy for the biological sciences (2005 ) Hammes,
Gordon G Wiley-Interscience
7. Biochemistry of signal transduction and regulation (2000)
Krauss, Gerhard. . Wiley-VCH 3527303782
8. Enzyme Kinetics : A Modern Approach (2002) Alejandro G.
Marangoni Wiley-Interscience 0471159859 |
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評量方式
(僅供參考) |
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No. |
項目 |
百分比 |
說明 |
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1. |
期中考 |
40% |
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2. |
期末考 |
50% |
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3. |
隨堂測驗 |
0% |
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4. |
作業 |
0% |
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5. |
報告 |
10% |
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週次 |
日期 |
單元主題 |
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第1週 |
09/18 |
Introduction to protein structure |
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第2週 |
09/25 |
Determination of protein structure |
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第3週 |
10/02 |
Molecular modeling |
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第4週 |
10/09 |
Molecular graphic and visualization |
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第5週 |
10/16 |
Demonstration of Modeller |
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第6週 |
10/23 |
Kinetics of single-substrate enzyme reactions |
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第7週 |
10/30 |
Kinetics of single-substrate enzyme reactions |
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第8週 |
11/06 |
Practical enzyme kinetics |
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第9週 |
11/13 |
Midterm 暫停上課一週 |
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第10週 |
11/20 |
Directed evolution of protein |
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第11週 |
11/27 |
Directed evolution of protein |
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第12週 |
12/04 |
Detection of protein interactions -phage display and yeast two-hybrid technologies |
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第13週 |
12/11 |
Electronic spectra/Circular Dichroism |
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第14週 |
12/18 |
NMR |
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第15週 |
12/25 |
Mass spectrometry |
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第16週 |
01/01 |
放假 |
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第17週 |
01/08 |
Molecular recognition and Protein-ligand binding equilibria (Signal transduction by nuclear receptors and GPCR) |
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